從市場大環境來說，這個問題沒有唯一答案，也沒有不變的答案。對于小規模的初創機構而言，LIMS應用最核心的價值在于保證質量的前提下盡可能地提高交付效率，而對于大規模成熟機構而言，最核心的價值可能在于規范操作，杜絕風險，保證業務正常穩定的運行。
那么對于前者（即效率優先），則必然要求系統做更多默認的工作，盡可能少地減少用戶的操作，盡量針對自身業務特定進行定制，而不用考慮太多現在用不上的功能 以及各種理想化的條件限制等等。隨著業務規模和特點的變遷，逐步做出調整開發，不能要求一步到位，既做不到，也不合理。
事實上，很多實驗操作人員并不喜歡使用LIMS應用系統，個人認為以下幾點是其中一部分原因：
1、增加工作量，而不是減輕工作量。以前只需要操作結束工作就結束了，現在還要再到LIMS中錄入一次數據，這必然是增加工作量的，至少對操作人本人短期而言如此（每隔一段時間讓操作員統計自己的操作記錄則另說，如與考核掛鉤，但此舉不太適合不成熟的團隊）。除非能夠做到操作員只需控制系統，相應的工作就能通過機器人完成，那么我想他們會樂于使用的。
2、LIMS應用系統背后都是需要人員操作和支持的，所以一個專業化的系統背后對應的是專業化的團隊，分工明確，職責清晰，如果團隊不具備這樣的前提就盲目上系統并強制要求，只會帶來抵觸心理。甚至會帶來由于工作職責邊界不清而導致的潛在風險。
3、實際使用LIMS產品的人未必意識到數據的重要性，這就需要管理者向利益相關人員等解釋和培訓。人性都是多一事兒不如少一事，違背人性的使用要求以及規章制度遲早都是會被淘汰的。
4、不同角色對系統的要求是不同的，管理者往往關注宏觀層面的統計以及風險控制，而執行者則只關心其每日的工作任務是否已經完成，訴求的不同必然導致了矛盾（中性詞）的產生。所以本質上是作為管理者和作為操作者這兩種角色之間的矛盾關系。所以當管理者強制要求執行某些操作時其實是在給操作者增加任務量，而操作者本人由于不是發自內心的認可這項工作，從而導致了不快。
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