實驗室數據安全保密性是實驗室通用要求，也是實驗室客戶、外部監管機構重點關注的內容。
實驗室保密內容可能是國家秘密、商業秘密或者技術秘密。
通過實驗室信息化管理系統LIMS來設置保密按鈕，確保實驗室數據庫管理系統的安全性。
一，原始記錄和報告的保密
對各項目的檢測原始記錄和檢驗報告，操作員須及時上傳LIMS系統保存，對外保密。
二，實驗室資料保存
妥善保存實驗室資料（特別是技術和檢測相關），不準私自外借，復制，傳送等；按照LIMS程序做好文件和記錄的保密管理,為保存的實驗室資料設置系統檔案，隨時可查，可以溯源。
三，實驗室為客戶檢測數據保密
實驗室在客戶處獲得的，或者在試驗過程中產生的各項檢測數據秘密，需為客戶保密，公開前得到客戶的同意，除非與客戶事先有約定，或者客戶已經公布。在LIMS應用中，在相應的客戶管理模塊，可以針對不同的客戶設置級別進行管理，確保數據安全性。
保密控制
業務員在接受客戶委托時， 要詢問客戶對樣品以及技術資料的保密是否有特殊的要求，將特殊要求信息填寫在委托單上，以便樣品及資料在流轉過程中接觸到的所有相關人員知曉并按照其要求執行。
對于樣品與資料的流轉， 只允許指定流轉人員接觸，其它人員未經允許不得擅自接觸樣品及瀏覽相關資料，因個人行為而導致的泄密情況將按照本程序內容進行處置。
樣品管理員針對有特殊保密要求的樣品在倉庫存放時應給予充分的保密措施;資料員對客戶所提供資料的存放不可較長時間的脫離其監控范圍，以免為無關人員獲得導致泄密，客戶的任何資料未經客戶同意，不得外借或無關人員查閱、復印。
四，實驗室人員管理權限設置
設置實驗室人員管理權限，層層管理者保密，實驗室管理者在LIMS系統中進行相應的管理權限設置，不同管理者管理的資料不同，落實保護機密信息和所有權的各項措施實施所需的資源和責任人，確保不泄露本實驗室的任何秘密。
五，工作崗位的替換
工作人員調離工作崗位，須歸還所保管的一切有關的技術資料，LIMS系統做好交接工作，管理者及時更換賬號，密碼等。
>>>以法律要求為準
實驗室依據法律要求或合同授權透漏保密信息時，應將所提供的信息通知到相關客戶或個人，除非法律禁止。如食品檢測,實驗室檢測出某 些致病菌，應直接上報相關部門，而不是告知客戶。
實驗室還可通過以下方式確保保密性
01 人員與實驗室簽訂保密協議，或在勞動合同中體現保密事項。并將所有的合同文件在LIMS系統中進行管理歸類，并進行相應的電子簽名等；
02 對所有人員進行職業道德培訓，強調保密的重要性；
03 制定和實施保密程序，包括保護電子儲存和結果信息、違反保密條例的處罰措施；
04 對不同崗位人員限制其可獲得的信息。在LIMS系統中對不同身份的人員進行權限管理；
05 對外公布保密性承諾。
